Kometen handlar om Gustav vars far en dag försvinner. Alla närstående är övertygade om att Gustavs far har tagit sitt liv men Gustav själv är helt säker på att han har blivit bortförd av ett UFO då en komet passerade jorden samma kväll som han försvann. Han upplevde ett märkligt ljus och fallande stenar samma kväll. Inget tror på Gustav och han lovar sin mor att aldrig nämna det igen. 11 år senare kommer kometen tillbaka. Under åren har Gustav tagit över sin fars jobb som ansvarig för motellet samtidigt som han tar hand om sin mor. Gustav tror fortfarande att han kommer att få träffa sin far igen när kometen återvänder och får hjälpa av den självutnämnda UFO-experten Bill som desperat söker efter bevis på liv ”där ute”. Gustav träffar också en flicka, Charlotte, som sätter hans förhållande till sin mor i obalans.